全基因表达谱分析维甲酸对大鼠肝纤维化的影响 被引量：2

1

作者 喻冬柯 高塬 +4 位作者 张彩霞 张胜华 甄永占 邵荣光 何红伟 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期1213-1216,共4页

目的探讨维甲酸对胆管结扎肝纤维化模型大鼠肝脏组织全基因表达谱的影响。方法应用维甲酸给予胆管结扎大鼠模型,用大鼠全基因芯片分析肝组织基因表达谱,并进行通路分析,实时定量PCR和Western blot分析与验证肝纤维化相关基因的表达变化... 目的探讨维甲酸对胆管结扎肝纤维化模型大鼠肝脏组织全基因表达谱的影响。方法应用维甲酸给予胆管结扎大鼠模型,用大鼠全基因芯片分析肝组织基因表达谱,并进行通路分析,实时定量PCR和Western blot分析与验证肝纤维化相关基因的表达变化。结果全基因组芯片分析表明:共有491个基因同时在模型组和维甲酸组中发生变化,该变化与细胞黏附、整合素等信号通路有关,并影响药物代谢,视黄醇代谢,淀粉、蔗糖和半乳糖代谢,脂代谢的相关信号通路。实时定量PCR检测结果显示,与模型组相比,维甲酸能抑制肝脏组织中肝纤维化相关基因(Col1a1和TGF-β)的mRNA水平,降低肝纤维化相关蛋白(TGF-β、α-SMA)的表达。结论维甲酸可以有效改善胆管结扎大鼠模型的肝纤维化的程度,逆转胆管结扎造成的基因表达变化,其中包括下调多种肝纤维化基因,从而发挥抗纤维化的作用。 展开更多

关键词 维甲酸 大鼠 胆管结扎 肝纤维化 信号通路 基因表达谱 基因芯片

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海藻提取物对链脲霉素糖尿病大鼠的降血糖作用 被引量：3

2

作者 喻冬柯 杨雯 +5 位作者 张梦雪 杜俊蓉 于传兴 李德山 赵长义 乔奎蕴 《华西药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期32-34,共3页

目的研究海藻提取物对正常大鼠和糖尿病大鼠血糖的影响。方法选用链脲霉素糖尿病大鼠为模型,观察海藻提取物对糖尿病模型大鼠的空腹血糖、糖耐量、体重、摄食量、饮水量、尿量和糖化血红蛋白的影响。结果海藻提取物能降低糖尿病大鼠的... 目的研究海藻提取物对正常大鼠和糖尿病大鼠血糖的影响。方法选用链脲霉素糖尿病大鼠为模型,观察海藻提取物对糖尿病模型大鼠的空腹血糖、糖耐量、体重、摄食量、饮水量、尿量和糖化血红蛋白的影响。结果海藻提取物能降低糖尿病大鼠的空腹血糖;能改善糖尿病大鼠的糖耐量;对糖尿病大鼠体重的降低有一定的改善作用;对糖尿病大鼠的摄食量、饮水量和尿量的增加有一定降低作用;提高剂组的糖化血红蛋白给药后28d与模型组比较有显著性差异。结论海藻提取物能有效地缓解链脲霉素诱发的糖尿病大鼠的高血糖症状。 展开更多

关键词 海藻 糖尿病 链脲雹素 降血糖作用

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低分子海藻酸钾降压作用及药动学的实验研究 被引量：4

3

作者 冀为 陈欲云 +7 位作者 杜俊蓉 喻冬柯 郑晓媛 杨芳 于传兴 李德山 赵长义 乔奎蕴 《四川大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期694-696,703,共4页

目的研究低分子海藻酸钾对自发性高血压大鼠(SHRs)血压的影响及其在小鼠体内的药动学规律。方法采用尾脉搏间接测压法测定SHRs收缩压,40只大鼠随机分为5组:空白溶媒对照组、氢氯噻嗪片剂组(6.25mg/kg)、低分子海藻酸钾高剂量、中剂量和... 目的研究低分子海藻酸钾对自发性高血压大鼠(SHRs)血压的影响及其在小鼠体内的药动学规律。方法采用尾脉搏间接测压法测定SHRs收缩压,40只大鼠随机分为5组:空白溶媒对照组、氢氯噻嗪片剂组(6.25mg/kg)、低分子海藻酸钾高剂量、中剂量和低剂量组(500、250、100mg/kg),每天灌胃给药,连续给药28d;每周测量血压,并观察停药后3d、6d的血压变化。KM种小鼠灌服3H-低分子海藻酸钾100mg/kg(74MBq/kg),分别于给药后2、5、10、20、30min以及1、2、4、6、12、24、48、72、96、120、144h尾部取血,测定样品放射性活性,经DAS2.0软件拟合低分子海藻酸钾口服给药在小鼠体内的药动学参数。结果与同期溶媒对照组比较,连续给药21d和28d,氢氯噻嗪和低分子海藻酸钾3个剂量组的SHRs血压水平均降低(P<0.01);停药3d和6d时,6.25mg/kg氢氯噻嗪的降压作用消失(P>0.05);在停药3d时,低分子海藻酸钾高、中、低3个剂量组的收缩压均低于同期溶媒对照组(P<0.05或P<0.01);停药6d时,250及500mg/kg低分子海藻酸钾仍可降低SHRs血压水平(P<0.01)。低分子海藻酸钾灌胃给药后在小鼠体内药动学规律符合二室模型,吸收相半衰期为2.76h,分布相半衰期为42.30h,消除相半衰期为42.31h,体内半衰期为36.28h。结论低分子海藻酸钾连续口服给药可剂量依赖性地降低SHRs血压,且停药6d仍呈现持续的降压作用,这可能与低分子海藻酸钾口服给药后体内消除缓慢有关。 展开更多

关键词 海藻酸钾 药动学 自发性高血压大鼠 降压作用

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虎杖提取物对α-葡萄糖苷酶的抑制作用 被引量：4

4

作者 郑晓媛 杜俊蓉 +3 位作者 杨芳 彭海燕 陈雏 喻冬柯 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期735-738,共4页

目的研究虎杖水溶性提取物对α-葡萄糖苷酶的作用。方法采用大孔吸附树脂柱色谱法进行虎杖水溶性总提取物初步分离,研究其总提取物和不同组分对α-葡萄糖苷酶活性的影响及其抑制反应的类型。结果虎杖总提取物(RRPC)与30%醇洗脱物(RRPCⅡ... 目的研究虎杖水溶性提取物对α-葡萄糖苷酶的作用。方法采用大孔吸附树脂柱色谱法进行虎杖水溶性总提取物初步分离,研究其总提取物和不同组分对α-葡萄糖苷酶活性的影响及其抑制反应的类型。结果虎杖总提取物(RRPC)与30%醇洗脱物(RRPCⅡ)对α-葡萄糖苷酶的IC50分别为74、15μg/mL,而蒸馏水(RRPCⅠ)、50%乙醇(RRPCⅢ)、70%乙醇(RRPCⅣ)、95%乙醇(RRPCⅤ)洗脱物的IC50均大于200μg/mL。结论RRPC及RRPCⅡ能显著抑制α-葡萄糖苷酶活性,RRPCⅡ的抑制机制为可逆性的非竞争性抑制。 展开更多

关键词 虎杖提取物 Α-葡萄糖苷酶 非竞争性抑制

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精神类药物的药物基因组学研究进展与临床应用 被引量：7

5

作者 张远 何霞 喻冬柯 《实用药物与临床》 CAS 2015年第6期729-733,共5页

目的总结归纳精神类药物的药物基因组学的研究进展,为临床个体化用药提供参考。方法以精神类药物、药物基因组学、个体化用药为关键词,通过搜索Pharm GKB、SNPedia、dbS NP等数据库,检索有关药物基因检测在精神障碍治疗中的应用的文献,... 目的总结归纳精神类药物的药物基因组学的研究进展,为临床个体化用药提供参考。方法以精神类药物、药物基因组学、个体化用药为关键词,通过搜索Pharm GKB、SNPedia、dbS NP等数据库,检索有关药物基因检测在精神障碍治疗中的应用的文献,并进行归纳总结。结果目前只有少数药物基因检测在治疗精神障碍中应用的证据较为充分,具有一定的临床意义,大多数基因检测还缺乏大规模的临床证据,需要进一步验证。结论药物基因组学是一门新兴学科,尚处于发展初级阶段,基因类型与药物疗效之间的关联性需要大规模的数据验证。在用于调整用药方案上,应结合其他临床指标。 展开更多

关键词 精神类药物 药物基因组学 个体化用药

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中国冠心病患者ApoE基因型和高敏C反应蛋白临床相关性研究 被引量：6

6

作者 熊萱 张远 +2 位作者 喻冬柯 陈果 童荣生 《四川医学》 CAS 2019年第6期549-552,共4页

目的探讨中国冠心病患者ApoE基因型和血清高敏C反应蛋白的表达及其临床意义。方法选取2015年6月至2018年5月收入的103例冠心病患者,对其进行ApoE基因型测定。根据ApoE基因型检测结果,将研究对象划分为E2/E3,E3/E3,E3/E4+E4/E4三组,对各... 目的探讨中国冠心病患者ApoE基因型和血清高敏C反应蛋白的表达及其临床意义。方法选取2015年6月至2018年5月收入的103例冠心病患者,对其进行ApoE基因型测定。根据ApoE基因型检测结果,将研究对象划分为E2/E3,E3/E3,E3/E4+E4/E4三组,对各组研究对象行血清高敏C反应蛋白浓度的检测,并进行统计学分析。结果E2/E3,E3/E3,E3/E4+E4/E4三组不同基因型患者其hs-CRP浓度为非正态分布,经轶和检验后,其轶值分别为64.85,51.40,和44.82,呈现逐步降低趋势,三者间差异无统计学意义(P=0.195)。结论在中国冠心病患者中,携带不同ApoE基因型患者其hs-CRP浓度虽无差异,但仍呈现了以E2/E3,E3/E3,E3/E4+E4/E4基因型为递减的趋势,说明携带E4基因型患者其生成CRP能力较低。在临床中,若能及时关注E4基因型患者hs-CRP浓度升高情况,可协助医务工作者判断疾病进程,更好的实现精准化治疗。 展开更多

关键词 冠心病 APOE基因型 高敏C反应蛋白

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利用TCGA公共数据库挖掘乳腺癌预后相关长链非编码RNA生物标志物 被引量：3

7

作者 熊萱 李一 +1 位作者 喻冬柯 张远 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期260-265,共6页

目的通过数据挖掘的方式分析美籍非裔乳腺导管癌/小叶癌女性患者的乳腺癌及癌旁组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),筛选出与乳腺癌生存期相关的lncRNA,并探讨其潜在的生物学意义。方法利用TCGA数据库获取美籍非裔女性150例乳腺导管... 目的通过数据挖掘的方式分析美籍非裔乳腺导管癌/小叶癌女性患者的乳腺癌及癌旁组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),筛选出与乳腺癌生存期相关的lncRNA,并探讨其潜在的生物学意义。方法利用TCGA数据库获取美籍非裔女性150例乳腺导管癌/小叶癌的癌组织和5例正常组织的转录组数据,采用Perl和R软件对数据进行提取、整理和分析,通过对差异表达的lncRNA进行单因素Cox回归分析,再将筛选得到的有显著性差异的基因进行多因素Cox比例风险回归模型分析,得到可将乳腺癌患者区分为高、低风险组的基因组合。采用lnCAR在线生存分析的方式验证筛选得到的基因。利用Pearson相关系数法筛选这些lncRNA的共表达基因,并将筛选得到的基因映射到metascape网站进行功能富集分析,探寻其潜在的调控网络。结果通过生物信息学分析筛选出在乳腺癌组织和正常组织中的表达差异具有显著性意义的差异表达lncRNA:lnc00640、PCAT6、HAGLROS和lnc00506。根据这4个lncRNA的表达模式将患者分为高、低风险组,其生存时间存在显著性差异(P<0.01)。这4个因素构建的模型,其一致性指数(C-index)为0.77(95%置信区间:0.67~0.87);其受试者工作特征曲线下面积为0.82,模型具有较好的准确性。结论lnc00640、PCAT6、HAGLROS、lnc00506这4个lncRNA的表达可能对乳腺癌患者预后起重要作用,值得在大量临床样本中进行验证和后续的机制探讨。利用数据挖掘的方式筛选乳腺癌相关lncRNA是一种高效而经济的研究方式。 展开更多

关键词 乳腺癌 长链非编码RNA TCGA数据库 生物信息学

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下调G3BP对抑制肿瘤细胞迁移能力的研究 被引量：1

8

作者 张浩 张彩霞 +2 位作者 喻冬柯 邵荣光 何红伟 《中国医药生物技术》 2015年第1期11-17,共7页

目的探讨利用siRNA和靶向G3BP的多肽药物下调G3BP后对多种肿瘤细胞迁移能力的影响。方法采用人纤维肉瘤HT1080细胞、乳腺癌MCF-7细胞以及人非小细胞肺癌H1299细胞,应用siRNA特异性干扰G3BP后,通过划痕实验观察其对肿瘤细胞迁移能力的影... 目的探讨利用siRNA和靶向G3BP的多肽药物下调G3BP后对多种肿瘤细胞迁移能力的影响。方法采用人纤维肉瘤HT1080细胞、乳腺癌MCF-7细胞以及人非小细胞肺癌H1299细胞,应用siRNA特异性干扰G3BP后,通过划痕实验观察其对肿瘤细胞迁移能力的影响;用多肽药物GAP161作用于肿瘤细胞后,利用划痕实验以及Transwell迁移实验观察其对肿瘤细胞迁移能力的影响;在MCF-7细胞中高表达G3BP1,在MDA-MB-231细胞中用siRNA下调G3BP1后,采用人全基因芯片分析G3BP1高表达和低表达后的基因表达谱,并进行信号通路分析。结果 siRNA特异性下敲G3BP1和G3BP2后,HT1080、MCF-7和H1299细胞的迁移能力显著降低。利用靶向G3BP的特异性多肽药物GAP161作用于多种肿瘤细胞后,肿瘤细胞的迁移能力显著下调。全基因组芯片分析表明:多个基因同时在G3BP1高表达和低表达组中发生变化,该变化与细胞迁移相关的细胞黏附、整合素、MAPK等信号通路有关。结论 G3BP下调后能够显著降低肿瘤细胞的迁移能力。靶向G3BP的多肽药物具有显著抑制肿瘤细胞迁移的作用。下调或者高表达G3BP后可通过下调或者上调多种与细胞黏附、整合素、MAPK等信号通路相关基因发挥作用。 展开更多

关键词 细胞系 肿瘤 细胞迁移抑制 基因表达谱 MAP激酶信号系统

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云南白药含漱剂的药效学研究 被引量：10

9

作者 高鹰 陈欲云 +7 位作者 冀为 王竞 陈娅姝 彭海燕 杨芳 喻冬柯 王雁兰 杜俊蓉 《中药药理与临床》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期12-14,共3页

目的:探讨云南白药含漱剂(HSJ)的抗炎、止血、促进牙龈组织微循环和口腔溃疡修复的药理作用。方法:通过角叉菜致大鼠足肿胀实验观察HSJ的抗炎作用;通过剪尾小鼠出血实验观察HSJ的止血作用;通过犬牙龈局部血流量的测定,观察HSJ对牙龈组... 目的:探讨云南白药含漱剂(HSJ)的抗炎、止血、促进牙龈组织微循环和口腔溃疡修复的药理作用。方法:通过角叉菜致大鼠足肿胀实验观察HSJ的抗炎作用;通过剪尾小鼠出血实验观察HSJ的止血作用;通过犬牙龈局部血流量的测定,观察HSJ对牙龈组织微循环的影响;通过对家兔口腔溃疡的影响观察HSJ对口腔溃疡愈合的促进作用。结果:HSJ有显著的抗炎、止血作用,可明显改善牙龈组织微循环、促进口腔溃疡修复。结论:云南白药含漱剂有显著的抗炎、止血、促进牙龈组织微循环和溃疡组织修复作用。 展开更多

关键词 云南白药含漱剂 抗炎 止血 微循环 口腔溃疡

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PDCA模式对提高药品库房缺药管理质量情况实践 被引量：19

10

作者 熊萱 郭栋 +4 位作者 尹琪楠 张远 喻冬柯 陈瑶 童荣生 《实用药物与临床》 CAS 2019年第1期102-105,共4页

目的探讨PDCA模式对于提高药品库房缺药管理质量的影响。方法选取2016年9-12月未采用PDCA循环法的西药库房作为对照组,2017年1-4月进行PDCA循环管理后的西药库房作为观察组,观察两组不同管理模式下药品供应商的综合评分情况,包括配送药... 目的探讨PDCA模式对于提高药品库房缺药管理质量的影响。方法选取2016年9-12月未采用PDCA循环法的西药库房作为对照组,2017年1-4月进行PDCA循环管理后的西药库房作为观察组,观察两组不同管理模式下药品供应商的综合评分情况,包括配送药物的缺药频次、缺药持续时间、零配送频次及零配送率。比较两组药品缺药后的药房知晓度及临床对药品供应的满意度情况。结果观察组的供应商供应情况综合评分高于对照组,差异有统计学意义(t=17. 38,P <0. 05)。在PDCA模式后的库房缺药管理,其配送药物的缺药频次、零配送频次及零配送率均明显降低(P <0. 05),缺药持续时间有所缩短,但差异无统计学意义(P=1. 06)。药房对缺药情况的知晓率及临床对药品供应的满意度明显提高。结论 PDCA模式可以有效提高药品库房缺药管理质量,降低药品的缺药情况,提高临床对药品供应的满意度。 展开更多

关键词 PDCA 库房管理 缺药管理 急救廉价药品 满意度

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乳腺导管癌差异表达基因的生物信息学分析 被引量：2

11

作者 熊萱 张远 +2 位作者 李一 喻冬柯 童荣生 《贵州医药》 CAS 2018年第9期1027-1030,1153,共4页

目的通过生物信息学的分析,比较乳腺导管癌和癌旁正常细胞的差异表达基因,挖掘筛选关键基因,为进一步的研究提供参考。方法通过利用ONCOMINE癌症微阵列数据库,挖掘差异表达基因,通过STRING、DAVID等工具使用生物信息学方法对其进行分析... 目的通过生物信息学的分析,比较乳腺导管癌和癌旁正常细胞的差异表达基因,挖掘筛选关键基因,为进一步的研究提供参考。方法通过利用ONCOMINE癌症微阵列数据库,挖掘差异表达基因,通过STRING、DAVID等工具使用生物信息学方法对其进行分析。结果挖掘出差异基因256个,其中不同分级的基因本体论(GO)194类,京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路236种。这些基因主要与血管生成、Ⅰ型干扰素信号通路、蛋白结合等有关,参与了生物化学信号通路、癌症信号通路、细胞受体信号传导通路、促分裂素原活化蛋白激酶信号通路等。构建表达蛋白的蛋白与蛋白互相作用的网络图,提示这些基因的表达产物大部分存在密切的相互作用。结论通过对乳腺导管癌易感差异基因的分析,对其易感基因有了系统的认识,针对关键基因的大样本研究及网络化基因分析是未来的研究方向。 展开更多

关键词 乳腺癌 导管癌 生物信息学

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瑞替普酶对比阿替普酶治疗中国急性心肌梗死患者疗效的Meta分析 被引量：17

12

作者 熊萱 喻冬柯 +4 位作者 张远 边原 尹琪楠 陈瑶 童荣生 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第9期1279-1284,共6页

目的:系统评价瑞替普酶对比阿替普酶治疗中国急性心肌梗死患者的疗效,为临床提供循证参考。方法:计算机检索Cochrane图书馆、PubMed、Embase、Medline、中国期刊全文数据库、中文科技期刊数据库、万方数据等,并手工检索相关文献,检索时... 目的:系统评价瑞替普酶对比阿替普酶治疗中国急性心肌梗死患者的疗效,为临床提供循证参考。方法:计算机检索Cochrane图书馆、PubMed、Embase、Medline、中国期刊全文数据库、中文科技期刊数据库、万方数据等,并手工检索相关文献,检索时限为1995年1月-2018年9月,收集瑞替普酶(试验组)对比阿替普酶(对照组)治疗中国急性心肌梗死患者疗效(溶栓再通率)的随机对照试验(RCT),对符合纳入标准的研究进行资料提取,并采用Cochrane系统评价员手册5.1.0进行质量评价后,采用Rev Man 5.3软件对溶栓再通率进行Meta分析。结果:共纳入23项RCT,合计1 742例患者。Meta分析结果显示,试验组患者溶栓再通率显著高于对照组,差异有统计学意义[OR=0.61,95%CI(0.50,0.73),P<0.001],根据溶栓再通成功时间进行亚组Meta分析,结果显示,试验组患者溶栓后1 h[OR=0.38,95%CI(0.25,0.58),P<0.001]、1.5 h[OR=0.44,95%CI(0.25,0.79),P=0.006]、2 h[OR=0.62,95%CI(0.42,0.92),P=0.02]的溶栓再通率均显著高于对照组,差异均有统计学意义。结论:中国急性心肌梗死患者使用瑞替普酶的溶栓再通率优于阿替普酶。 展开更多

关键词 阿替普酶 瑞替普酶 急性心肌梗死 中国 META分析

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利用生物信息学数据库筛选药物药动学、药效学相关基因及其多态性位点 被引量：15

13

作者 张远 何霞 +3 位作者 串俊兰 钟磊 喻冬柯 熊萱 《实用药物与临床》 CAS 2018年第9期1073-1077,共5页

目的以抗抑郁药物西酞普兰为例,通过生物信息学数据库搜索和分析可能导致(艾司)西酞普兰个体化差异的基因及多态性位点,为药物基因组学研究的基因和位点选取模式提供参考。方法选取3个常用免费生物信息学数据库GeneCards、UniProtKB和Ph... 目的以抗抑郁药物西酞普兰为例,通过生物信息学数据库搜索和分析可能导致(艾司)西酞普兰个体化差异的基因及多态性位点,为药物基因组学研究的基因和位点选取模式提供参考。方法选取3个常用免费生物信息学数据库GeneCards、UniProtKB和PharmGKB,以"西酞普兰OR艾司西酞普兰"用于基因的筛选。利用将筛选到的基因名称输入ClinVar数据库,筛选基因的多态性位点。以"西酞普兰OR艾司西酞普兰AND基因多态性"的搜索方式搜索PubMed和CBM文献数据并统计和比较搜索到的基因名称及出现频率。结果从GeneCards、UniProtKB和PharmGKB生物信息学数据库中选取了共有的4个基因,在ClinVar中搜索到了这4个基因与临床药物应答相关的共19个多态性位点。而从PubMed上搜索到的文献中出现频率最高的前4个基因与GeneCards、UniProtKB和PharmGKB生物信息学数据库中搜索到的共有基因有较高的一致性。结论利用GeneCards、UniProtKB、PharmGKB搜索基因+ClinVar搜索多态性位点的模式,能更快速准确地找到临床相关性更大的基因和多态性位点,相比搜索文献数据库的方式,能节约更多时间和精力,对研究设计阶段和统计阶段的数据降维处理也有一定的帮助。 展开更多

关键词 生物信息学数据库 药物基因组学 基因多态性

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亚甲基四氢叶酸还原酶677C>T基因多态性与不良妊娠结局和血同型半胱氨酸水平的相关性 被引量：11

14

作者 张远 何霞 +2 位作者 钟磊 串俊兰 喻冬柯 《中国新药与临床杂志》 CSCD 北大核心 2017年第8期477-483,共7页

目的系统评价亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)677C>T基因多态性对不良妊娠结局和血同型半胱氨酸水平的关联性。方法检索Pub Med、万方医学网、中国知网中母亲MTHFR基因677C>T位点多态性与不良妊娠结局的病例对照研究。提取相关数据... 目的系统评价亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)677C>T基因多态性对不良妊娠结局和血同型半胱氨酸水平的关联性。方法检索Pub Med、万方医学网、中国知网中母亲MTHFR基因677C>T位点多态性与不良妊娠结局的病例对照研究。提取相关数据并应用Rev Man5.0软件进行Meta分析。结果共纳入19篇文献,病例组共2 973例,对照组共5 787例。采用共显性遗传模式(CC vs.TT和CT vs.TT)计算合并OR(95%CI):CC vs.TT为1.29(1.09~1.54),CT vs.TT为1.20(0.99~1.45),提示T等位基因与不良妊娠结局有相关性(P<0.05)。CT vs.TT亚组分析显示CT型是唐氏综合征和早产的危险因素:OR(95%CI)为2.16(1.49~3.13),但因为分亚组后文献数量较少结论可靠性待确定。对于血同型半胱氨酸(Hcy)水平与不良妊娠结局的关系,共纳入7篇文献,病例组417例,对照组445例,与对照组相比,Hcy的水平无差别,OR(95%CI)为0.14(-0.14~0.42)。结论 MTHFR TT型是发生不良妊娠结局的一个危险因素,CT型在不同的不良妊娠结局中结论不一致,而Hcy水平与不良妊娠结局无关。 展开更多

关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 高半胱氨酸 妊娠结局

原文传递

获得性免疫缺陷综合征患者易感抑郁症差异表达基因的生物信息学分析

15

作者 熊萱 张远 +1 位作者 喻冬柯 童荣生 《重庆医学》 CAS 2020年第13期2183-2186,2192,共5页

目的探索获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者易感抑郁症的关键差异表达基因,为进一步研究寻找靶点。方法通过GEO数据库下载AIDS合并抑郁症患者和AIDS患者额叶皮层灰质细胞的基因芯片数据集GSE17440,利用R语言挖掘差异表达基因,通过STRING、... 目的探索获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者易感抑郁症的关键差异表达基因,为进一步研究寻找靶点。方法通过GEO数据库下载AIDS合并抑郁症患者和AIDS患者额叶皮层灰质细胞的基因芯片数据集GSE17440,利用R语言挖掘差异表达基因,通过STRING、metascape等工具进行生物信息学分析。结果挖掘出差异表达基因71个,其中上调基因16个,下调基因55个。经过不同的富集工具富集,差异表达基因主要集中于细胞凋亡通路。构建蛋白与蛋白互相作用的网络图显示,差异表达基因的表达产物大部分存在密切的相互作用,AIDS合并抑郁症患者脑部组织免疫防御反应异常激活。结论通过对AIDS合并抑郁症患者和AIDS患者差异表达基因的分析,对其差异基因有了系统的认识,针对关键基因的大样本研究及网络化基因分析是未来的研究方向。 展开更多

关键词 获得性免疫缺陷综合征 抑郁症 灰质 生物信息学 差异表达基因

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高山绿茶提取物对小鼠高胆固醇血症及脂肪肝的防治作用及其机制 被引量：4

16

作者 张裕沛 杨雪琴 +3 位作者 喻冬柯 郑紫星 吴梅岭 杜俊蓉 《华西药学杂志》 CAS CSCD 2021年第2期183-187,共5页

目的研究高山绿茶提取物(GTE)对小鼠高胆固醇血症及脂肪肝的影响及其作用机制。方法C57 BL/6小鼠随机分为正常对照组、高脂饲料喂养模型组及其加用GTE防治的低、中、高剂量组。喂养28 d后,检测血脂、肝功、肝脏氧化指标,肝脏行HE染色、... 目的研究高山绿茶提取物(GTE)对小鼠高胆固醇血症及脂肪肝的影响及其作用机制。方法C57 BL/6小鼠随机分为正常对照组、高脂饲料喂养模型组及其加用GTE防治的低、中、高剂量组。喂养28 d后,检测血脂、肝功、肝脏氧化指标,肝脏行HE染色、油红O染色,检测小肠中尼曼-匹克C1样蛋白1(NPC1L1)和甾醇反应元件结合蛋白2(SREBP2)的mRNA和蛋白水平。结果GTE可剂量依赖性地改善小鼠高胆固醇血症、肝功、病理学改变、肝脏氧化损伤与脂质沉积,并降低小肠NPC1L1和SREBP2的mRNA和蛋白水平。结论GTE可预防小鼠高胆固醇血症及脂肪肝,其作用机制与下调小肠NPC1L1和SREBP2基因的表达、减少胆固醇的吸收相关。 展开更多

关键词 绿茶提取物 茶多酚 高胆固醇血症 脂肪肝 NPC1L1 SREBP2 吸收

原文传递

基因多态性与他莫昔芬代谢的相关研究进展 被引量：2

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作者 熊萱 张远 +5 位作者 喻冬柯 吴家蓉 唐静 唐薇 杨雨 童荣生 《临床药物治疗杂志》 2018年第8期15-20,共6页

他莫昔芬(tamoxifen,TAM),作为预防及治疗雌激素受体(estrogen receptor, ER)阳性乳腺癌内分泌治疗的一线药物,其在临床应用中存在明显的个体差异。这与其药物代谢过程中细胞色素P450酶系(cydochrome P450,CYP)、磺基转移酶(sulfotransf... 他莫昔芬(tamoxifen,TAM),作为预防及治疗雌激素受体(estrogen receptor, ER)阳性乳腺癌内分泌治疗的一线药物,其在临床应用中存在明显的个体差异。这与其药物代谢过程中细胞色素P450酶系(cydochrome P450,CYP)、磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)、葡萄路醛酸转移酶(UDP-glucuronosyl transferase,UGT)、黄素单氧化酶成员(flavin-containing monooxygenases,FMOs)和人类ABC转运蛋白等酶系的基因多态性密切相关。TAM的药物基因组学已在临床应用中起到一定作用,随着其研究不断深入,基因多态性对TAM疗效的影响,将为临床治疗的个体化用药提供更多的理论依据。 展开更多

关键词 他莫昔芬 基因多态性 药物基因组学

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亚洲人群肝细胞癌mRNA-miRNA表达谱整合分析挖掘疾病治疗靶点 被引量：2

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作者 张远 熊萱 喻冬柯 《中国新药与临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期120-124,共5页

目的通过整合数据库分析筛选出与亚洲人肝细胞癌(HCC)生存期相关微小RNA(miRNA),并探讨该miRNA潜在的生物学调控网络。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取亚洲人群HCC癌组织编码基因(mRNA)和miRNA表达量数据集,采用perl语言和R语... 目的通过整合数据库分析筛选出与亚洲人肝细胞癌(HCC)生存期相关微小RNA(miRNA),并探讨该miRNA潜在的生物学调控网络。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取亚洲人群HCC癌组织编码基因(mRNA)和miRNA表达量数据集,采用perl语言和R语言对数据进行提取、整理和分析,利用加权基因共表达网络(WGCNA)获取miRNA的共表达基因,并对筛选得到的差异表达miRNA进行Kaplan-Meier生存分析,筛选出对总生存时间存在影响的miRNA。通过与WGCNA筛选得到的共表达基因和miRNA靶基因预测数据库miRPathDB结合探寻其潜在靶基因,并通过metascape网站进行功能预测。结果通过TCGA共下载到6例正常、126例HCC癌组织的mRNA表达量数据集和6例正常、166例HCC癌组织的miRNA表达量数据集,通过生物信息学分析筛选出hsa-mir-139-5p差异表达具有显著意义,且对HCC总生存期有显著影响,通过预测其靶基因,发现其与脂质代谢、碳代谢等代谢通路相关。结论hsamir-139-5p可作为潜在的HCC治疗靶点,但需要后续实验验证。利用生物信息学手段筛选生物标志物或治疗靶标,是一种高效而经济的研究方式。 展开更多

关键词 癌 肝细胞 微RNAS 数据挖掘

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